主页 > 生命科学 >

【科普】WikiGenes,真正适合科学家的维基(wiki)

作者:钱俊斌 http://www.newgene.cn

一、wiki现状
人们对维基(wiki)的印象,大约很多都是来自维基百科。作为目前互联网上最完善、参与人数最多的电子互动百科全书,维基百科几乎成了wiki的代名词,它的成功不仅使其自己成为wiki家族中的一个标准,而且促使wiki这个基于web页面的协作系统在互联网上越来越受到欢迎。 wiki是一种全新的知识网络系统,目前已经在各个领域得到了广泛的应用。它和博客系统一样,正在慢慢地改变着人们的生活和工作方式。
wiki在科学领域也有不少的应用,比如在维基百科上,你能找到一些科学领域的名词解释以及概况介绍,有的也是挺详细,看上上去很有说服力。但它存在的一些问题会令科学家们对它望而却步:

1. 参与这些条目编辑的人是谁,我们并不知道,他们是科学家,也许又不是。为了确保条目的中立性,维基百科采取了这种匿名修改的方式。但这对科学家来说,这并不是好事,这就意味着你不能完全相信该信息来源的可靠性,而对科学研究而言,这种可靠性是有重大意义的。
2. 虽然维基百科也有良好的参考文献编目功能,也有历史版本记录。但是我们可以想象,当这个条目被不同的人编辑了若干次之后,这种参考文献编目将陷于混乱,而历史版本记录对你找到某个论断的具体来源也是帮助甚微。
3. 著作权问题上,如果成果被大量引用,而其作者来源不能被很好的标注出来,这会造成发表这些成果的科学家的贡献不能被人们很好的认识,对这些科学家来说这是非常不公平的。要知道,对科学家来说,能被其他科学家以及大众所认同,是其赢得声誉的重要来源之一。

二、什么是WikiGenes

Wikigenes是一个基于wiki的基因信息数据库,由瑞士的研究员、MIT的访问学者Robert Hoffmann博士领导开发。该数据库的网址为:http://www.wikigenes.org/ 。WikiGenes这个网站是建立在名为Mememoir 的项目上的。介绍该成果的文章目前已经发表在了著名的Nature Genetics杂志上(文章链接)。它的开发者还寻求将 Mememoir 开源的可能。Robert Hoffmann 说,这是后期会考虑事,目前正集中精力运行 Wikigenes 网站项目。



其区别于NCBI、EBI上不断增加但却未经合理组织的数据,Wikigenes以每个基因的功能与特性为提纲对基因进行描述,比如按与疾病的关系、生物学上的关系、解剖学上的关系、与酶的作用、诊断学上的意义等等来分类描述,当然这些分类还可以更加详细、更加有针对性,这些内容部分是由计算机来完成(iHOP,这是Robert Hoffmann参与的另一个相关项目),但大部分还是由网站的用户来参与编辑和完善的。在科学数据不断增加的今天,如果我们不对他们进行重新组织和整理,那就意味着我们每次开始研究某一基因的时候,都需要重头开始查阅文献,组织和整理文献。而如果每个人都能够把查阅并组织整理文献的成果都放到web页面上,那将节省多少宝贵的时间,减少多少无谓的重复劳动呀?
以上这些功能在普通的wiki如维基百科中也能实现,那么Wikigenes区别于维基百科的地方在哪里呢?

1. 完善的著作追踪系统。Wikigenes上面的任何成果、论断都可以精确定位到所引用的文章以及作者上。浏览者可以很清楚的看到这些话是哪个注册用户编辑的,以及来源于哪篇文章。这对鼓励原创、增加条目的权威性和可信度都是非常有益的。
2. 声誉评价系统。我们知道同行评阅在科学界是惯例。在wiki中,一般认为有兴趣阅读和编辑wiki相关条目的人的应该也是对该条目比较了解的人,或者也能称之为该条目所属领域中的同行。那么这些人对科学家所作贡献的评价将是具有一定知识基础以及相对的客观性的。Wikigenes提供了这么一项功能,就是允许和鼓励wiki读者以及编辑者对wiki条目中所涉及的作者的贡献进行评价。这种评价将给文章的作者带来一定的声誉。得到的认可评价越多,那么该作者在该条目页面的作者排位栏中将更加靠前,这表明作者在该领域做出的贡献越大。
3. 强大的科学术语跟踪系统。在线电子出版物和传统出版物相比,其内容上的优势之一就是可以提供超链接,这样读者通过点击超链接就可以轻易地了解某些术语的解释以及相关资料了。在普通领域,一个术语缩写也许就只代表一种意思,但在生物学和医学上,由于使用了大量的术语缩写,同一缩写代表多种含义的情况就屡见不鲜了,所以必须对这种缩写所代表的含义加以选择和甄别。 Wikigenes就提供了这样一个内链管理模式,通过编辑者的选择,科学术语能够准确地定位到其对应的含义上。

阅读本文的人还阅读:

英科学家尝试抑制器官移

【bio-news】三位科学家

【medical-news】我科学家发

【medical-news】科学家鉴定

新一代华裔科学家在生命

作者:admin@医学,生命科学    2011-07-30 05:11
医学,生命科学网