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【每日动态】新方法可预测流感病毒基因重组
在我们身边的生态环境中，有各种流感病毒，它们有的彼此只存在非常细微的差别，研究者们至今缺乏足够的知识认定哪种病毒会引起大流感。病毒的衍变有些具有明显的生物学意义，有些则并不具有。由于它们衍变的出口太多，研究人员只能跟在它们后面被动追击，而做不到主动出击到病毒前面进行防守。科学家们总是感叹只能成为事后诸葛亮，唯一可以预测的就是病毒的不可预测性。
然而近日公布在GenomeWeb一条最新消息或许将改变被动的现状。新加坡基因组研究所12月27日发表声明称他们与美国马里兰大学的研究人员合作开发出了一种新方法可以高度准确和敏感地预测流感病毒基因组的危险变异。研究论文发表在了近期的《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志上。
论文中提到了一种可预测病毒基因组重组的自动程序包，研究人员将其命名为GiRaF。GiRaF是由新加坡基因组资深科学家Niranjan Nagarajan和美国马里兰大学的计算机科学助理教授Carl Kingsford协作开发的。GiRaF主要是基于流感基因组大量数据和病毒基因组所有片段分析的基础上对病毒基因组的重组做出预测。
GiRaF采用了一种数据挖掘技术寻找给定的序列样品中的重组序列。这种方法以早期的方法为基础，及通过构建“不相容图”比较候选树的分布，并利用一种快速搜索算法挖掘系统发生的不一致性。然后再利用系统发生距离检测改进错误的阳性率，再将从基因组所有片段获得的结果组合到一起生成一个综合的重组表从而预测出近期以及系统深度重组。
“GiRaF除了可用于检测流感，还能对病毒基因组重组的过程进行更系统的研究，以便我们预测新型流感病毒出现的时间和方式。”Niranjan Nagarajan说。（来源：生物通 何嫱） http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2010/12/20/nar.gkq1232.abstract 流感病毒的重组、变异是病毒环境与宿主综合作用的结果 这其中包含太多的偶然性和必然性
预测之说个人认为只是纸上谈兵 没有太大的实际意义 科学研究动态监测快报文件类型:PDF/Adobe Acrobat- 文字版科学研究动态监测快报 2010 年4月1日第7期(总第 128 期) 生命科学专辑 中国科学院规... 最终指南意识到,需要利用 创新方法研制新一代药品,从而保证应对流感大流行今天比过去...www.library.sh.cn/...0年第7期.pdf-2010-12-25-科学研究动态监测快报" 医药动态文件类型:DOC/Microsoft Word- 文字版新方法通过逐个观察DNA片段上碱基的颜色来确定序列,精确度很高. 摘自《中国医药报... “454生命科学”公司计划在大约一年时间内,破译沃森完整的基因组图谱.沃森本人一个...125.223.205.241/...y2005-2.doc-2010-12-15-医药动态" 生命科学研究快报文件类型:DOC/Microsoft Word- 文字版【科技发展动态:科研工作】 【传染病专栏】 【专利信息】 中国科学院生命科学与生物... 近日Journal of Biology杂志刊登的一篇文章提出了一种预测哺乳动物基因功能的新方法....www.library.sh.cn/...04/63.doc-2010-11-15-生命科学研究快报"[标签:content2]
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作者:admin@医学,生命科学 2011-01-09 00:02
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